由于地域关系和历史原因，闽南端午习俗在延续中华民族传统习俗的同时，也保留了各自独特的民风习俗，形成了形态各异、丰富多彩的民俗活动。

福建省民俗学会常务副会长石奕龙教授说，闽南过端午共同的习俗有三类：一类是驱毒、驱虫、避邪类，如端午节午时用兰草水洗浴、炒盐作为午时盐、采草药作为午时茶；一类是吃碱粽子、发糕等端午仪式食品；一类是划龙舟，兼有中原文化和海洋文化的特点。

闽南各地还有各自独特的端午习俗。据介绍，泉州端午节有很多祈福消灾习俗，包括门楣插“五瑞”（即五种植物）、小孩胸佩香袋、泡雄黄酒、炒午时盐等。另外还有一种谐趣的驱邪消灾的习俗叫“采莲”，采莲队伍中有铺兵、锣鼓阵、花童或男扮女装的提花婆，由一位扮相邋遢不堪、手举长杆幡旗的“醉汉”充当前导，最后由四人抬着一具木雕龙头压阵，为沿途的民众入室舞旗拂扫。